Het complex is eigendom van Stichting Ebbingehof, waarvan het vijfkoppige bestuur uitsluitend uit leden van de woongemeenschap bestaat. De relatie tussen stichting en de bewoners is verder gewaarborgd op twee manieren: de bewoners zijn georganiseerd in de Raad van Bewoners met recht van voordracht voor een bestuurslid van de stichting. Daarnaast is de Raad van Participanten in het leven geroepen. Participanten zijn huurders die een lening aan de stichting hebben verstrekt. Ook zij hebben het recht een bestuurslid van de stichting voor te dragen.

De bouwsom van het complex was 13,5 miljoen euro. Iets minder dan de helft daarvan wordt gedekt een hypotheek. Omdat Ebbingehof tien sociale huurappartementen heeft -een kwart van het totaal- leende de gemeente Groningen Ebbingehof drie miljoen euro. Het resterende bedrag van zo’n vier miljoen euro is door ‘participanten’ aan de stichting uitgeleend. In de meeste gevallen wordt de rente over deze lening verdisconteerd met de maandelijkse huur.